Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms