Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CCDC136Q96JN2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms