Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms