Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTV1Q96GA3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTV1Q96GA3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms