Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRP36Q96EU6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRP36Q96EU6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms