Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHFRQ96EP1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHFRQ96EP1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms