Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SIRT1Q96EB6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIRT1Q96EB6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms