Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMD3Q96D46 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms