Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDAQ92838 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EDAQ92838 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EDAQ92838 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EDAQ92838 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EDAQ92838 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms