Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX38Q92620 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX38Q92620 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms