Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D1Q8WV19 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D1Q8WV19 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms