Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM87AQ8NBN3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM87AQ8NBN3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms