Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NHLRC2Q8NBF2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NHLRC2Q8NBF2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms