Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP38Q8NB14 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms