Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVBPQ8N300 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms