Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VWDEQ8N2E2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VWDEQ8N2E2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms