Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z2

ABRA, Actin-binding Rho-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAQ8N0Z2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABRAQ8N0Z2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABRAQ8N0Z2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms