Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TMEM61Q8N0U2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms