Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXP4Q8IVH2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms