Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP2Q86UW6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
N4BP2Q86UW6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms