Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTU1Q7Z7A3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTU1Q7Z7A3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms