Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP1Q7RTM1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms