Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM5Q71RC9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMIM5Q71RC9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms