Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC129Q6ZRS4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC129Q6ZRS4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms