Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRCAPQ6ZRS2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRCAPQ6ZRS2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms