Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms