Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC144NLQ6NUI1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC144NLQ6NUI1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms