Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NANOGP8Q6NSW7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms