Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX8Q68G74 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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