Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHEQ5VZ18 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms