Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD13Q5VXD3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms