Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRNL1Q5VV63 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms