Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf135Q5VTT2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms