Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOGA3Q5TF21 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms