Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC183Q5T5S1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms