Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP70Q5T0N1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms