Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms