Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ANKRD39Q53RE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms