Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms