Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPAT3Q53EU6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPAT3Q53EU6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms