Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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