Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC153Q494R4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC153Q494R4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms