Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCB5Q2M3G0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCB5Q2M3G0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms