Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC96Q2M329 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC96Q2M329 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms