Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL24A1Q17RW2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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