Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FXNQ16595 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FXNQ16595 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FXNQ16595 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FXNQ16595 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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FXNQ16595 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FXNQ16595 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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