Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK4Q16099 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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