Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USF2Q15853 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
USF2Q15853 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USF2Q15853 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USF2Q15853 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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