Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCOA1Q15788 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCOA1Q15788 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
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