Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TAF1AQ15573 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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